美里以及她的反NERV組織WILLE來到巴黎，這裡被核心染成紅色，AAA Wunder奇跡號的船員降落在安全塔上，他們只有720秒能修復這個城市。NERV的福音戰士群出現時，真希波的EVA改8號機進行攔截。與此同時，真嗣、明日香和麗（暫稱）在日本的土地上徘徊。