世界在撒拉熱窩發生核子炸彈恐怖襲擊之後，美國為了進行反恐控管，於是建構了徹底的資訊監控系統；另一方面，落後國家出現大規模的內戰與屠殺事件，全球逐漸陷入嚴重分裂。美國因此創立了全新的情報部隊，進行情報蒐集與戰爭犯罪者的暗殺。

作為美軍情報部隊的王牌精英克拉維斯．薛帕德接受了美軍上層的命令——暗殺煽動各國內戰的戰爭罪犯「約翰．保羅」，在追查這些腥風血雨的同時，薛帕德也意外地得知「虐殺器官」的存在，因而開始找尋真相……